Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms