Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms