Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc6D3YZP9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
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