Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam47eD3YWC7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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