Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Calcoco2A2A6M5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Calcoco2A2A6M5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms