Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms