Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q2

Ighv5-9, Immunoglobulin heavy variable 5-9 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ighv5-9A0A075B5Q2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-9A0A075B5Q2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-9A0A075B5Q2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-9A0A075B5Q2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-9A0A075B5Q2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-9A0A075B5Q2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-9A0A075B5Q2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-9A0A075B5Q2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-9A0A075B5Q2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-9A0A075B5Q2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-9A0A075B5Q2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-9A0A075B5Q2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-9A0A075B5Q2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-9A0A075B5Q2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-9A0A075B5Q2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ighv5-9A0A075B5Q2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms