Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cldn6Q9Z262 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn6Q9Z262 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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