Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z204

Hnrnpc, Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpcQ9Z204 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HnrnpcQ9Z204 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HnrnpcQ9Z204 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms