Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt71Q9R0H5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt71Q9R0H5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms