Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek3Q9R0A5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms