Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ldb3Q9JKS4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ldb3Q9JKS4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms