Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc12a4Q9JIS8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms