Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pus3Q9JI38 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms