Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrnb2Q9ERK7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms