Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn2Q9ER65 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms