Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rexo2Q9D8S4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms