Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7P7

Clic3, Chloride intracellular channel protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic3Q9D7P7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Clic3Q9D7P7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Clic3Q9D7P7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Clic3Q9D7P7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Clic3Q9D7P7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Clic3Q9D7P7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Clic3Q9D7P7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Clic3Q9D7P7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Clic3Q9D7P7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Clic3Q9D7P7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clic3Q9D7P7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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