Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc94Q9D6J3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc94Q9D6J3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms