Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SarnpQ9D1J3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms