Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arv1Q9D0U9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms