Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nde1Q9CZA6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nde1Q9CZA6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.2 ms