Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms