Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed5Q9CXE7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms