Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim3Q99PE5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim3Q99PE5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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