Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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TrabdQ99JY4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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TrabdQ99JY4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TrabdQ99JY4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TrabdQ99JY4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TrabdQ99JY4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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