Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nrif1Q923B3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms