Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn1Q922Y1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms