Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msi2Q920Q6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms