Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atpaf2Q91YY4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms