Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx9Q91VH2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx9Q91VH2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms