Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Colec12Q8K4Q8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms