Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sde2Q8K1J5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sde2Q8K1J5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms