Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FgbQ8K0E8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms