Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Csnka2ipQ8CH19 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Csnka2ipQ8CH19 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Csnka2ipQ8CH19 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Csnka2ipQ8CH19 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnka2ipQ8CH19 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Csnka2ipQ8CH19 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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