Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Usp27Q8CEG8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Usp27Q8CEG8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp27Q8CEG8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Usp27Q8CEG8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Usp27Q8CEG8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Usp27Q8CEG8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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