Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lin52Q8CD94 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms