Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8CC96 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8CC96 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8CC96 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8CC96 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8CC96 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8CC96 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8CC96 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8CC96 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8CC96 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8CC96 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8CC96 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q8CC96 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q8CC96 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q8CC96 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CC96 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CC96 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CC96 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CC96 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CC96 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CC96 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CC96 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CC96 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CC96 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CC96 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CC96 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CC96 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CC96 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CC96 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CC96 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CC96 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CC96 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CC96 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CC96 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CC96 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CC96 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CC96 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CC96 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CC96 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CC96 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CC96 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CC96 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CC96 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CC96 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CC96 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CC96 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CC96 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CC96 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CC96 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CC96 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms