Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CntrobQ8CB62 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms