Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssuh2Q8C3L1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms