Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXZ0

Ctxn3, Cortexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn3Q8BXZ0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctxn3Q8BXZ0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms