Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rd3Q8BRE0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rd3Q8BRE0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms