Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zcchc4Q8BKW4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms