Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg2bQ80XK6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms