Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc1Q80VQ1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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