Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dsg1cQ7TSF0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dsg1cQ7TSF0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms