Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ckap2lQ7TS74 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms