Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TwistnbQ78WZ7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwistnbQ78WZ7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms