Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms