Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ0

Cd300a, CMRF35-like molecule 8, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300aQ6SJQ0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd300aQ6SJQ0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms